Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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