Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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USP18Q9UMW8 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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