Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCSER1Q9C0I3 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCSER1Q9C0I3 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms