Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DTX3Q8N9I9 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DTX3Q8N9I9 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DTX3Q8N9I9 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms