Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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