Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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