Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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