Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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