Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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