Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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