Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXE3Q13461 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXE3Q13461 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXE3Q13461 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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