Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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