Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms