Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 RPL12P32-201ENST00000484010 494 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 HSD3BP4-201ENST00000511509 1120 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 CCT8-212ENST00000626972 1862 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 KPNA5-201ENST00000356348 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
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HOXD11P31277 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 RN7SL14P-201ENST00000579715 298 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
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