Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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HOXA3O43365 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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HOXA3O43365 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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HOXA3O43365 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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