Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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FOXQ1Q9C009 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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FOXQ1Q9C009 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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FOXQ1Q9C009 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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FOXQ1Q9C009 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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FOXQ1Q9C009 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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FOXQ1Q9C009 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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