Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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