Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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