Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms