Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms