Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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