Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms