Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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TCOF1Q13428 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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TCOF1Q13428 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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TCOF1Q13428 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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TCOF1Q13428 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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TCOF1Q13428 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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TCOF1Q13428 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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TCOF1Q13428 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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TCOF1Q13428 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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TCOF1Q13428 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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TCOF1Q13428 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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