Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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