Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
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FOXF2Q12947 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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