Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC173Q0VFZ6 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms