Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms