Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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