Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ZNF548Q8NEK5 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ZNF548Q8NEK5 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ZNF548Q8NEK5 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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