Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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