Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NRF1Q16656 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms