Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms