Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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DDX39BQ13838 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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