Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK2Q13002 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms