Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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