Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ERVV-2B6SEH9 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms