Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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