Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms