Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms