Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms