Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms