Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms