Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms