Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN4Q5BKX8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms