Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC178Q5BJE1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms