Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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RPE65Q16518 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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RPE65Q16518 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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RPE65Q16518 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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RPE65Q16518 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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RPE65Q16518 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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RPE65Q16518 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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RPE65Q16518 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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RPE65Q16518 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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RPE65Q16518 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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