Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MSLNQ13421 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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