Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREMQ03060 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREMQ03060 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREMQ03060 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREMQ03060 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREMQ03060 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms