Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms