Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn1bP97952 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms